SI-Apimodel
La base APIMODEL contient les données d’environ 4 000 colonnies, essentiellement issues de suivi de miellée (Lavandes et Tounesol). Une partie de cette base plus spécifiquement dédiée à Varroa est en cours de construction. Les données de la base sont issues des programmes de collaboration de INRA-BioSP avec les ADAs( ADAPI, ADANA, ADAPIC, ADA-Occitanie), les Conseils régionaux de PACA et Auvergne-Rhône-Alpes et l’UMT PrADE (Avignon).
carto vp100
La base de données varroas VP100AB est une base de données construite en collaboration avec de nombreux partenaires (ADAAQ, ADAPI, INRA-BioSP). Cette base présente l’ensemble des mesures de la charge en varroas, évaluée par l’indice VP/100AB (nombre de varroas phorétiques pour 100 abeilles).
SMITID Dashboard demo
Statistical Methods for Inferring Transmissions of Infectious Diseases from deep sequencing data (SMITID). This dashboard allow to explore populations and pathogens in a genetico-spatio-temporal way using several HTMLWidgets from https://cran.r-project.org/web/packages/SMITIDvisu/ . This is a demo with real and simulated data.
Landsepi Demo
A spatio-temporal stochastic model to assess resistance deployment strategies against plant pathogens. The model is based on stochastic geometry for describing the landscape and the resistant hosts, a dispersal kernel for the dissemination of the pathogen, and a SEIR (Susceptible-Exposed-Infectious-Removed) architecture to simulate plant response to disease.
Nématode du Pin
Application Shiny permettant de visualiser les données relatives aux travaux réalisés dans le cadre du groupe de travail sur le nématode du pin.
Biological Risk Assessment
A spatio-temporal exposure-hazard model for assessing biological risk and impact. The model is based on stochastic geometry for describing the landscape and the exposed individuals, a dispersal kernel for the dissemination of contaminants and an ecotoxicological equation.
Plan de Surveillance officielle
Dans le cadre du groupe de travail structuration des plans de surveillance officielle, la plateforme ESV a développé une cartographie du risque d'émergence des organismes de quarantaine prioritaires en France métropolitaine basé sur différents critères de risque.
Map Covid19
Simple Shiny App Based on Data of Covid 19 release by Johns Hopkins University Center for Systems Science and Engineering (JHU CSSE). See their github repository https://github.com/CSSEGISandData/COVID-19
ToBRFV
Application interactive créée par la Plateforme ESV dans le cadre de la surveillance du virus de la tomate, ToBRFV.
MacroparApp
Application interactive créée par Nathéo Beauchamp et Frédéric Hamelin dans le cadre de recherches théoriques en cours sur la détection des interactions entre macro-parasites.
Geoflow
Application to faciliate the management of (meta)data workflows based on the geoflow R package. https://github.com/eblondel/geoflow-shiny
ipsimcirsium
IPSIM-cirsium is a tool developped by INRA for professionals in agriculture to predict and manage the dam age caused by thistle on crops in France.
Concept-Dig
Le projet Concept-Dig financé par l’ADEME (2016-2019) et porté par INRAe a eu comme objectif de produire un outil d’aide à la conception de filière de traitement de digestats agricoles pour leur utilisation agronomique. Cet outil repose sur une enquête menée auprès de 72 sites de méthanisation de l’AAMF (Agriculteurs Méthaniseurs de France) et sur des expérimentations et suivis des procédés de traitement des digestats (séparation de phases, stockage, compostage et incubation sur sols).
surveillance nematode du pin
Application interactive créée par la Plateforme ESV pour la visualisation des données de surveillance du nématode du pin issues des différents acteurs du réseau de surveillance en France.